Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc5P27641 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms