Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
U2af2P26369 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
U2af2P26369 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
U2af2P26369 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
U2af2P26369 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
U2af2P26369 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms