Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnna1P26231 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnna1P26231 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms