Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gabra2P26048 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms