Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Znf239P24399 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Znf239P24399 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Znf239P24399 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Znf239P24399 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Znf239P24399 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Znf239P24399 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Znf239P24399 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Znf239P24399 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Znf239P24399 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Znf239P24399 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms