Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Mocs2-210ENSMUST00000183407 1074 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm42733-201ENSMUST00000201272 519 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Pfdn4-202ENSMUST00000075087 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Olfr73-201ENSMUST00000099838 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AC135083.1-201ENSMUST00000227773 1331 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 AC166902.3-201ENSMUST00000216696 991 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd11P23813 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm6348-201ENSMUST00000200751 1443 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm6468-201ENSMUST00000201076 1443 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm6346-201ENSMUST00000201146 1443 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd11P23813 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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