Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkchP23298 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkchP23298 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms