Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gja1P23242 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms