Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PparaP23204 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PparaP23204 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PparaP23204 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PparaP23204 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms