Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb9P20615 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb9P20615 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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