Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NefhP19246 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NefhP19246 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NefhP19246 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NefhP19246 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NefhP19246 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NefhP19246 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NefhP19246 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NefhP19246 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NefhP19246 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms