Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxb1P17919 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxb1P17919 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hoxb1P17919 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hoxb1P17919 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxb1P17919 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxb1P17919 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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