Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Defa-rs1P17533 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa-rs1P17533 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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