Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rag1P15919 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rag1P15919 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rag1P15919 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms