Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Srp54P14576 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Srp54P14576 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54P14576 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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