Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Vpreb1P13372 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms