Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Calb1P12658 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calb1P12658 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms