Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcp1P11983 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms