Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Schip1P0DPB4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Schip1P0DPB4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms