Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Tmem254bP0DN90 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms