Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Surf1P09925 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Surf1P09925 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Surf1P09925 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms