Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Itgb1P09055 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Itgb1P09055 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms