Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Col4a2P08122 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms