Protein–RNA interactions for Protein: P06837

Gap43, Neuromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gap43P06837 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gap43P06837 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms