Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-Eb1P04230 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-Eb1P04230 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms