Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04213 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P04213 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P04213 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P04213 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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