Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53P02340 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tp53P02340 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms