Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01843 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01843 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01843 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms