Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01648 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01648 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01648 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01648 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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