Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01641 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01641 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01641 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01641 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01641 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms