Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdc6O89033 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms