Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AvilO88398 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AvilO88398 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AvilO88398 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AvilO88398 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AvilO88398 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AvilO88398 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AvilO88398 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AvilO88398 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AvilO88398 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AvilO88398 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AvilO88398 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms