Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnnt1O88346 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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