Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChkbO55229 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms