Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cbx4O55187 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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