Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Eif6O55135 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif6O55135 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif6O55135 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif6O55135 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif6O55135 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Eif6O55135 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif6O55135 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms