Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Aff2O55112 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Aff2O55112 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Aff2O55112 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Aff2O55112 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aff2O55112 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Aff2O55112 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aff2O55112 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Aff2O55112 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aff2O55112 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Aff2O55112 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Aff2O55112 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Aff2O55112 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Aff2O55112 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Aff2O55112 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Aff2O55112 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms