Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DffaO54786 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DffaO54786 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DffaO54786 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffaO54786 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffaO54786 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffaO54786 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffaO54786 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffaO54786 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffaO54786 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffaO54786 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DffaO54786 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DffaO54786 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms