Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sdc4O35988 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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