Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Klf9O35739 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Klf9O35739 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Klf9O35739 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms