Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ppfibp2O35711 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ppfibp2O35711 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms