Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RaxO35602 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RaxO35602 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RaxO35602 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaxO35602 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaxO35602 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaxO35602 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaxO35602 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RaxO35602 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms