Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Kpna3O35344 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kpna3O35344 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms