Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptpn9O35239 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ptpn9O35239 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptpn9O35239 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptpn9O35239 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ptpn9O35239 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptpn9O35239 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptpn9O35239 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptpn9O35239 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn9O35239 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ptpn9O35239 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms