Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smad6O35182 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms