Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ArxO35085 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ArxO35085 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ArxO35085 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ArxO35085 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ArxO35085 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ArxO35085 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ArxO35085 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ArxO35085 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ArxO35085 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ArxO35085 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ArxO35085 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms