Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casq1O09165 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms