Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snap23O09044 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snap23O09044 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Snap23O09044 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Snap23O09044 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms