Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Eftud2O08810 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms