Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klf6O08584 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klf6O08584 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms